基本信息

职称：副教授

职务：

邮箱：ywj@njfu.edu.cn

电话：

杨文杰，1996年生，理学博士，副教授。主要研究方向为分子生态学、进化生态学与基因组进化。长期基于生态学理论与组学数据（基因组、群体重测序、转录组等），结合生物地理学与分子功能验证等手段，围绕物种起源、群体历史、性状演化与适应机制等核心科学问题开展研究。

先后参与多项国家自然科学基金项目，系统研究了高山植物双果荠属的生物地理学历史、香雪球的驯化与花色演化机制、以及猕猴桃属超级泛基因组结构变异与表型多样性等问题。以第一作者（含共同）发表研究论文7篇，代表性成果发表于 Molecular Ecology、Molecular Ecology Resources、Horticulture Research 等权威期刊。

教育经历

2014.09 - 2018.06       海南大学           热带农林学院              生物科学          学  士

2018.09 - 2025.06       四川大学           生命科学学院     生物学（硕博连读）   博  士

工作经历

2025.08 -  至   今       南京林业大学     生态与环境学院        自然保护地系      副教授

科研项目

南京林业大学高层次人才引进启动经费，2025，在研，主持

科研成果

（*为通讯作者，#为共同第一作者，下同）

1.        Yang W, Feng L, Jiao P, Xiang L, Yang L, Olonova MV, Chepinoga VV, Al-Shehbaz IA, Liu J*, Hu Q*. Out of the Qinghai-Tibet plateau: Genomic biogeography of the alpine monospecific genus Megadenia (Biscutelleae, Brassicaceae). Molecular Ecology. 2023 Jan;32(2):492-503. (【代表作1】生物学一区，IF₂₀₂₃= 4.5)

该研究基于全球分布样本，系统揭示了高山单种属植物双果荠（Megadenia pygmaea）由青藏高原向北迁移的历史轨迹，首次提出该类群在末次盛冰期实现了“走出青藏高原”的扩散模式。研究发现低海拔边缘群体由高原起源，并在气候变迁中逐步形成遗传分化，且其适应性进化可能受到自然选择驱动。该工作为揭示高原植物如何应对冰期气候提供了新证据，并对理解高山植物的间断分布、生存机制及适应演化具有重要意义。

2.        Yang W#, Zhang L#, Mandáková T, Huang L, Li T, Jiang J, Yang Y, Lysak MA, Liu J, Hu Q*. The chromosome-level genome sequence and karyotypic evolution of Megadenia pygmaea (Brassicaceae). Molecular Ecology Resources. 2021 Apr;21(3):871-879. (【代表作2】，生物学一区，IF₂₀₂₁= 8.678)

染色体数目和结构的变化是推动植物物种与种系多样化的重要因素。该研究首次构建了高山植物双果荠（Megadenia pygmaea）的染色体水平参考基因组，并结合比较染色体绘图对其核型进行探究，明确了其系统发育位置位于十字花科Lineage II的基部，该分支包含许多重要农业作物。研究发现，双果荠的核型结构与十字花科原始PCK核型高度相似，但在其演化过程中经历了一次特定的“端到端”染色体融合事件，导致染色体数目由祖先的n = 7减少到n = 6。这一特定的单次染色体融合事件首次在该属明确鉴定，为十字花科Lineage II基部物种的核型演化提供了新的实证案例。研究构建的高质量参考基因组不仅为深入理解双果荠的染色体结构变化及其进化历史提供了重要资源，也为后续探索十字花科物种染色体数目非整倍型减少的演化机制，以及高山植物的适应性进化奠定了坚实基础。

3.        Yang W, Liu M, Feng L, Jiao P, Jiang J, Huang L, Liu J*, López-Pujol J*, Hu Q*. Domestication history and genetic changes for the newly evolved flower color in the ornamental plant Lobularia maritima (Brassiaceae). Horticulture Research. 2025; 12(4): uhae355. (【代表作3】农林科学一区，IF₂₀₂₄= 8.5)

该研究首次系统揭示了栽培花卉香雪球（Lobularia maritima）的驯化历史及花色演化的遗传机制。通过对野生与栽培群体的比较分析，发现所有栽培品种源自突尼斯地区的单次驯化事件，其中紫花性状在驯化后新近演化而来。进一步研究确定关键调控因子PAP1的两种基因单倍型分别对应白花与紫花，并通过功能实验证实其对花色相关结构基因的调控能力存在显著差异。这一成果不仅厘清了该重要园艺植物的驯化路径和表型演化机制，也为解析园艺植物花色多样性的分子基础、拓展野生资源在育种中的利用潜力提供了理论支撑与基因资源。

4.        Wu H#, Yang W#, Dong G, Hu Q*, Li D*, Liu J*. Construction of the super pan-genome for the genus Actinidia reveals structural variations linked to phenotypic diversity. Horticulture Research. 2025; 12(6): uhaf067. (【代表作4】共同一作，农林科学一区，IF₂₀₂₄= 8.5)

该研究构建了猕猴桃属（Actinidia）的超级泛基因组，整合了七个代表性类群的14个单倍型基因组，全面揭示了结构变异在果实性状、抗病性等表型多样性中的潜在作用。研究发现，多数表型相关基因（如TTG1、MED25、RPM1）在不同材料间存在显著的差异，部分变异可能通过调控基因表达、剪接或剂量效应影响表型。该工作为猕猴桃属物种资源的遗传解析、抗病育种与表型改良提供了关键基因资源和参考框架。

   全部论文

1.        Yang W#, Zhang L#, Mandáková T, Huang L, Li T, Jiang J, Yang Y, Lysak MA, Liu J, Hu Q*. The chromosome-level genome sequence and karyotypic evolution of Megadenia pygmaea (Brassicaceae). Molecular Ecology Resources. 2021 Apr;21(3):871-879. (【代表作2】，生物学一区，IF₂₀₂₁= 8.678)

2.        Yang W, Feng L, Jiao P, Xiang L, Yang L, Olonova MV, Chepinoga VV, Al-Shehbaz IA, Liu J*, Hu Q*. Out of the Qinghai-Tibet plateau: Genomic biogeography of the alpine monospecific genus Megadenia (Biscutelleae, Brassicaceae). Molecular Ecology. 2023 Jan;32(2):492-503. (【代表作1】生物学一区，IF₂₀₂₃= 4.5)

3.        Yang W, Liu M, Feng L, Jiao P, Jiang J, Huang L, Liu J*, López-Pujol J*, Hu Q*. Domestication history and genetic changes for the newly evolved flower color in the ornamental plant Lobularia maritima (Brassiaceae). Horticulture Research. 2025; 12(4): uhae355. (【代表作3】农林科学一区，IF₂₀₂₄= 8.5)

4.        Wu H#, Yang W#, Dong G, Hu Q*, Li D*, Liu J*. Construction of the super pan-genome for the genus Actinidia reveals structural variations linked to phenotypic diversity. Horticulture Research. 2025; 12(6): uhaf067. (【代表作4】共同一作，农林科学一区，IF₂₀₂₄= 8.5)

5.        Yang W#, Jiang C#, Bi C, Zhao Z, Fu C, Li F, Hou Z, Hu Q, Wang Z*. A haplotype-resolved chromosomal-level genome assembly of Oxalis articulata. Scientific Data. 2025 May 23;12(1):856. (综合性二区，IF₂₀₂₃= 5.8)

6.        Yang W#, Huang Z#, Fu C, Zhao Z, Yang X, Hu Q, Wang Z*. Predicting range shifts of five Alnus (Betulaceae) species in China under future climate scenarios. Plants. 2025; 14(11):1597. (生物学二区，IF₂₀₂₃= 4.0)

7.        Yang W#, Fu C#, Zhao Z, Zhang W, Yang X, Hu Q, Wang Z*. Assessing climate change risks and conservation needs for Carpinus species in China using ensemble distribution modeling. Forests. 2025; 16(6):888. (IF₂₀₂₃= 2.4)

8.        Chen C, Yang W, Liu J, Xi Z, Zhang L, Hu Q*. Population transcriptomics reveals gene flow and introgression between two non-sister alpine gentians. Frontiers in Ecology and Evolution. 2021;9. (IF₂₀₂₁= 4.493，2/6)

9.        Huang L#, Ma Y#, Jiang J, Li T, Yang W, Zhang L, Wu L, Feng L, Xi Z, Xu X, Liu J, Hu Q*. A chromosome-scale reference genome of Lobularia maritima, an ornamental plant with high stress tolerance. Horticulture Research. 2020 Dec 1;7(1):197. (农林科学一区，IF₂₀₂₀=6.793，5/12)

10.    Hu Q#, Ma Y#, Mandáková T#, Shi S, Chen C, Sun P, Zhang L, Feng L, Zheng Y, Feng X, Yang W, Jiang J, Li T, Zhou P, Yu Q, Wan D, Lysak MA, Xi Z*, Nevo E*, Liu J*. Genome evolution of the psammophyte Pugionium for desert adaptation and further speciation. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2021 Oct 19;118(42):e2025711118. (综合性一区，IF₂₀₂₁= 12.779，11/20)

11.    Feng L#, Yao Y#, Kang M, Yang W, Han Y, Liu W, Li X, Li N, Hu Y, Liu J, Hu Q*. Integrated genomic, transcriptomic, and metabolomic analyses of Ilex hylonoma provide insights into the triterpenoid saponin biosynthesis. The Plant Journal. 2024 Nov;120(3):1176-1189. (生物学一区，IF₂₀₂₃= 6.2，4/11)

12.    Xiao M#, Hao G#, Guo X, Feng L, Lin H, Yang W, Chen Y, Zhao K, Xiang L, Jiang X, Mei D, Hu Q*. A high-quality chromosome-level Eutrema salsugineum genome, an extremophile plant model. BMC Genomics. 2023 Apr 5;24(1):174. (生物学二区，IF₂₀₂₃=3.5，6/12)

13.    Li T, Yu X, Ren Y, Kang M, Yang W, Feng L, Hu Q*. The chromosome-level genome assembly of Gentiana dahurica (Gentianaceae) provides insights into gentiopicroside biosynthesis. DNA Research. 2022 Feb 27;29(2):dsac008. (生物学二区，IF₂₀₂₂= 4.1，5/7)

14.    Feng L, Lin H, Kang M, Ren Y, Yu X, Xu Z, Wang S, Li T, Yang W, Hu Q*. A chromosome-level genome assembly of an alpine plant Crucihimalaya lasiocarpa provides insights into high-altitude adaptation. DNA Research. 2022 Jan 28;29(1):dsac004. (生物学二区，IF₂₀₂₂= 4.1，9/10)

15.    Yang Q#, Bi H#, Yang W, Li T, Jiang J, Zhang L, Liu J, Hu Q*. The genome sequence of alpine Megacarpaea delavayi identifies species-specific whole-genome duplication. Frontiers in Genetics. 2020 Aug 3;11:812. (IF₂₀₂₀=4.599，3/8)